結局個人的なファイルってLinuxパソコン、サーバーやUbuntuのどこに置くのがいいのか、正解なのか、という疑問について少し調べてみたのでシェアします。
個人的なファイル、例えばスクリプトだったりプログラムだったり、ドキュメントファイルだったり動画や画像だったり色々ですが、そういうたぐいのファイルはどこに置くのがいいのか、という話ですが、

/home/

に置くのがいいようです。

e.g. /home/data/

僕の場合はこういうふうにしています。”/home”のルートディレクトリはなにかと荒れますからね。色々プログラムなどをaptやらでインストールしていると、ディレクトリやドットディレクトリ、ドットファイルが増えていきます。はじめの時点からも”.bashrc”や”.bash_profile”などそこそこファイルが散らかっているので、できればこういうふうにしておくとベストプラクティスかもしれません。

directory – Where should I keep my personal files while keeping the pathname short? – Ask Ubuntu