yuis ASUS /mnt/c/pg$ cat > hoge.txt
hoge
hoge
fuga
fuga
foo
foo
yuis ASUS /mnt/c/pg$ cat > hoge02.txt
hoge
fuga
foo
foo

meld <(cat hoge.txt) <(cat hoge02.txt )

<( [commmad] )で、出力をテンポラリファイルとしてmeldに渡しています。

shell – Create a temporary file from a stdout redirect or pipe – Unix & Linux Stack Exchange